D-ヴォイドとの死闘を経てサイバートロン星はついに再生を果たした。オートボット司令官という己の役目を終えたオプティマス・プライムは、故郷の星を後進に託し、大宇宙へと旅立った。突然の事態に戸惑いつつも、故郷の星で新たな歩みを始めるオートボットとディセプティコン。しかし、かつての恩讐…